Ziel des interdisziplinären Forschungsverbundes ist es, systemübergreifend Gesetzmässigkeiten in Mikrobiomen zu erkennen. Zudem wollen die Forschenden Mikrobiome konstruieren oder gezielt verändern. Dies kann zum Beispiel dazu genutzt werden, um Krankheitserreger bei Menschen und Pflanzen zu eliminieren oder Mikroorganismen mit gewünschten Eigenschaften zu stabilisieren. Auf diese Weise wollen die Wissenschaftler lernen, das Potenzial von Mikrobiomen auszuschöpfen. Am NFS «Microbiomes» wirken Forschende aus dem Universitätsspital Lausanne, drei weiteren Departementen der ETH Zürich, der EPFL, der Universität Bern und der Universität Zürich mit.
Die Laufzeit des NFS beträgt vier Jahre, kann aber zweimal um eine zweite und dritte Phase auf insgesamt zwölf Jahre verlängert werden.
